tailieunhanh - Sử dụng mạng Nơron Hopfield dự đoán cấu trúc thứ cấp của Ribonucleic Acid

Trong bài toán này, phân tích cách tiếp cận các bài toán nhờ mạng nơ ron nhân tạo. Nhờ mạng này các ràng buộc đặt lên cấu trúc RNA được xử lý. Mời các bạn tham khảo! | T¹p chÝ Khoa häc & C«ng nghÖ – Sè 1(41)/N¨m 2007 Sö dông m¹ng n¬ron Hopfield dù ®o¸n cÊu tróc thø cÊp cña RiboNucleic Acid §Æng Quang ¸ (ViÖn C«ng nghÖ th«ng tin- ViÖn KH&CN ViÖt Nam) N«ng ThÞ Hoa (Khoa C«ng nghÖ th«ng tin, §H Th¸i Nguyªn) 1. Giíi thiÖu RNA (RiboNucleic Acid) lµ mét axÝt tham gia vµo qu¸ tr×nh dÞch m# tõ DNA (DeoxyriboNucleic Acid) sang Protein. RNA ®−îc cÊu thµnh tõ c¸c ®¬n ph©n tö: AminoAcid, Nucleotide vµ Monosaccharide (xem [3]). RNA phôc vô hai môc ®Ých sinh häc: RNA lµ ph−¬ng tiÖn chuyÓn th«ng tin tõ DNA vµo c¸c s¶n phÈm cña Protein, RNA ho¹t ®éng nh− mét thµnh phÇn cña Ribosom. ViÖc dù ®o¸n cÊu tróc kh«ng gian cña RNA b»ng thùc nghiÖm rÊt tèn kÐm c¶ vÒ thêi gian vµ chi phÝ. V× thÕ, trong thêi gian gÇn ®©y ng−êi ta ®# sö dông c¸c c«ng cô to¸n häc vµ tin häc vµo môc ®Ých dù ®o¸n cÊu tróc cña RNA còng nh− gi¶i quyÕt nhiÒu bµi to¸n kh¸c cña c«ng nghÖ sinh häc. Trong bµi b¸o nµy chóng t«i tiÕp cËn bµi to¸n nhê m¹ng n¬ron nh©n t¹o Hopfield [7]. M¹ng nµy lµ mét c«ng cô rÊt h÷u hiÖu ®Ó gi¶i quyÕt c¸c bµi to¸n tèi −u hãa vµ tháa m#n rµng buéc [1], [2]. Nhê sö dông m¹ng nµy mµ c¸c rµng buéc ®Æt lªn cÊu tróc cña RNA ®# ®−îc xö lý. KÕt qu¶ m« pháng trªn m¸y tÝnh cho mét sè thÝ dô ®# chøng tá tÝnh kh¶ thi cña ph−¬ng ph¸p dù ®o¸n nhê m¹ng n¬ron. Bài b¸o gåm c¸c néi dung sau: PhÇn 2 m« t¶ bµi to¸n dù ®o¸n cÊu tróc thø cÊp RNA. PhÇn 3 tr×nh bµy lêi gi¶i cña bµi to¸n nhê sö dông m¹ng n¬ ron Hopfield. PhÇn 4 lµ kÕt luËn vµ h−íng nghiªn cøu tiÕp theo. 2. Bµi to¸n dù ®o¸n cÊu tróc thø cÊp RNA . CÊu tróc cña RNA (xem [3], [7]) AxÝt Nucleic chøa th«ng tin vÒ cÊu tróc vµ chøc n¨ng cña mét tæ chøc sèng mµ c¸c th«ng tin nµy ®−îc l−u tr÷ vµ di truyÒn cho lÇn sinh s¶n tiÕp theo. Cã hai kiÓu nucleotide trong axÝt Nucleic: DNA vµ RNA. Khi c¸c nucleotide h×nh thµnh mét chuçi DNA hoÆc RNA th× nhãm phosphate cña mét nucleotide t¹o mét liªn kÕt ho¸ häc víi ph©n tö oxygen g¾n víi ph©n tö c¸cbon cña nucleotide tiÕp theo. §o¹n xo¾n kÐp ®−îc thiÕt lËp khi hai ®Çu nót DNA .

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
crossorigin="anonymous">
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.