tailieunhanh - Xây dựng quy trình phân type đa hình đơn nucleotide trên gen IFNL4 có liên quan đến sự thanh thải virus viêm gan C

Nội dung bài viết xây dựng một quy trình phân tử để xác định đa hình đơn nucleotide (Single Nucleotide Polymorphism-SNP) trên gen IFNL4 bằng kỹ thuật real-time PCR với hai Taqman probe đặc hiệu cho mỗi dạng đa hình của ss469415590. Quy trình xây dựng gồm các bước: 1) Tách chiết DNA người từ máu toàn phần; 2) Nhân bản DNA người đã tách chiết trong phản ứng real-time PCR (Polymerase chain reaction) với cặp mồi ss469415590_IFNL4_F và ss469415590_IFNL4_R và hai Taqman probe đặc hiệu cho mỗi dạng đa hình là ss469415590_IFNL4_FAM cho đa hình G và ss469415590_IFNL4_VIC cho đa hình TT. Quy trình đã xây dựng được đánh giá trên 95 mẫu DNA người và tính được tần số allele TT là 93 % trong khi G là 7 %. Kết quả so sánh giữa hai phương pháp trên 10 mẫu lâm sàng cho thấy quy trình phân type ss469415590 bằng real-time PCR có độ chính xác là 100 %. | TAÏP CHÍ PHAÙT TRIEÅN KH&CN, TAÄP 20, SOÁ T1 - 2017 Xây dựng quy trình phân type đa hình đơn nucleotide trên gen IFNL4 có liên quan đến sự thanh thải virus viêm gan C Nguyễn Trung Hiếu Trần Thị Nhựt Linh Nguyễn Hữu Hùng Trường Đại học Nguyễn Tất thành Nguyễn Hoàng Chƣơng Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, ĐHQG-HCM ( Bài nhận ngày 19 tháng 9 năm 2016, nhận đăng ngày 10 tháng 04 năm 2017) TÓM TẮT Chúng tôi xây dựng một quy trình phân tử để xác hiệu cho mỗi dạng đa hình là định đa hình đơn nucleotide (Single Nucleotide ss469415590_IFNL4_FAM cho đa hình G và Polymorphism-SNP) trên gen IFNL4 bằng kỹ thuật ss469415590_IFNL4_VIC cho đa hình TT. Quy trình real-time PCR với hai Taqman probe đặc hiệu cho đã xây dựng được đánh giá trên 95 mẫu DNA người mỗi dạng đa hình của ss469415590. Quy trình xây và tính được tần số allele TT là 93 % trong khi G là dựng gồm các bước: 1) Tách chiết DNA người từ 7 %. Kết quả so sánh giữa hai phương pháp trên 10 máu toàn phần; 2) Nhân bản DNA người đã tách mẫu lâm sàng cho thấy quy trình phân type chiết trong phản ứng real-time PCR (Polymerase ss469415590 bằng real-time PCR có độ chính xác là chain reaction) với cặp mồi ss469415590_IFNL4_F 100 %. và ss469415590_IFNL4_R và hai Taqman probe đặc Từ khóa: ss465415590, real-time PCR, SNP, interferon, Taqman probe MỞ ĐẦU Các nghiên cứu liên kết toàn bộ gene (Genome Wide Association Study-GWAS) đã phát hiện được sự liên quan giữa các đa hình đơn nucleotide (Single Nucleotide Polymorphism-SNP) và sự thanh thải virus viêm gan C (Hepatitis C Virus-HCV) ở các bệnh nhân khi điều trị bằng interferon (IFN) kết hợp ribavirin. Cụ thể là ở SNP rs12979860, người mang genotype C/C có tỷ lệ đáp ứng siêu vi bền vững (Stable Viral Response-SVR) cao hơn các genotype khác như C/T hoặc T/T. Tương tự ở SNP rs8099917, người mang genotype T/T có tỷ lệ SVR cao hơn người mang genotype T/G và G/G [1, 2]. Với lý do này, việc phân biệt genotype có liên quan đến các SNP này là cần thiết để tiên lượng khả năng đáp .

• Sinh học
• Quy trình phân type đa hình đơn nucleotide
• Virus viêm gan C
• Đa hình đơn nucleotide
• Single Nucleotide Polymorphism
• Quá trình tách chiết
• Đề tài nghiên cứu khoa học
• Tách chiết collagen
• Quy trình tách chiết collagen
• Tách chiết collagen từ da cá Tra
• Ứng dụng collagen trong công nghệ thực phẩm
• Quá trình thủy phân collage
• Đồ án tốt nghiệp đại học
• Công nghệ sinh học
• Quá trình tách chiết anthocyanin
• Dịch chiết anthocyanin
• Phương pháp xác định hoạt tính kháng oxy hóa
• Quá trình thu nhận anthocyanin
• Tách chiết flavonoid
• Cây gai xanh
• Boehmeria nivea L
• Ảnh hưởng của nồng độ ethanol
• Tối ưu hóa quá trình tách chiết
• Quá trình tách chiết Saponin
• Tách chiết Saponin từ hạt chôm chôm
• Xác định hàm lượng saponin
• Trích ly Saponin trong hạt chôm chôm
• Quá trình tách chiết enzyme protease
• Quá trình tinh sạch enzyme protease
• Nội tạng cá Basa
• Dung môi chiết enzyme protease
• Tách chiết betacyanin
• Tách chiết betacyanin từ vỏ quả thanh long
• Xác định hàm lượng betacyanin
• Hàm lượng phenol tổng
• Bột màu thực phẩm
• Công nghệ hóa
• Quá trình chiết tách
• Concrete vetiver
• Tinh dầu
• Hóa vô cơ
• Chiết xuất
• Quá trình tách chiết protein
• Quá trình tinh sạch protein
• Rong bún Enteromorpha spp
• Công nghiệp thức ăn gia súc
• Chiết dung môi
• Thiết bị chiết khuấy lắng
• Môi trường axit sunphuric
• Bã thải quá trình điện phân
• Hệ số tách Zn/Cd
• Tạp chí phân tích
• Quá trình tách cellulose và lignin
• Quá trình tách cellulose và lignin từ rơm rạ
• Phương pháp kiềm
• Chiết xuất kiềm
• Quá trình phân hủy Diazinon
• Thuốc trừ sâu Diaphos
• Môi trường đất
• Quy trình chiết tách
• Tách chiết saponin triterpenoid
• Quá trình chiết xuất saponin triterpenoid
• Bã hạt cây Sở (Camellia oleifera)
• Hàm lượng saponin triterpenoid
• Mô hình bề mặt đáp ứng
• An toàn dinh dưỡng
• Quá trình tách chiết phenolic kháng oxi hoá
• Hoạt động sản xuất công nghệ thực phẩm
• Quả sim chín
• Quy trình sản xuất rượu sim
• Tối ưu đa mục tiêu
• Tổ hợp S và R
• Quá trình chiết tách chất màu Anthocyanin
• Chất màu anthocyanin
• Chuẩn tối ưu tổ hợp S
• Chuẩn tối ưu tổ hợp R
• Tạp chí Khoa học & Công nghệ
• Quá trình tách chiết limonene
• Vỏ cam Sành
• Box Behnken
• Xác định hàm lượng limonene
• Hoạt tính sinh học của tinh dầu cam
• Công nghệ nông nghiệp
• Bài viết về nông nghiệp
• Tinh bột khoai lang tím
• Khoai lang tím
• Công nghệ thực phẩm
• Khóa luận tốt nghiệp
• Tách chiết polyphenol
• Thức ăn chăn nuôi
• Thức ăn chăn nuôi giàu chất béo
• Kiểm soát quá trình oxy hóa
• Dinh dưỡng học
• Quá trình xử lý enzyme
• Xử lý enzyme thịt quả ổi
• Chiết tách dịch ổi
• Sản xuất nước ổi cô đặc
• Quá trình chiết
• Nguyên tố đất hiếm
• Hệ số tách
• Mạng no ron
• Mô hình toán học
• Đồ án công nghê thực phẩm
• Trích ly collagen từ da cá tra
• Quá trình thủy phân collagen bằng enzyme
• Đánh giá chất lượng sản phẩm
• CHIẾT TÁCH TANNIN
• tuyển tập báo cáo
• nghiên cứu khoa học
• đề tài nghiên cứu
• chuyên ngành khoa học
• công nghệ môi trường
• kỹ thuật khao học
• Chất chondroitin sulfate
• Ứng dụng protease ngoại bào
• Bacillus subtilis B26
• Tách chiết chondroitin sulfate
• Sụn cá đuối
• Sụn cá nhám
• Công nghệ nhiệt đới
• Tách chiết Omega 3
• Phụ phẩm chế biến cá
• Chế biến thủy sản
• Quá trình thủy phân mỡ cá lỏng
• chức năng sinh hóa
• chiếu xạ tia X
• quá trình tinh sạch
• Thu nhận protein
• Phân tách protein
• Hoạt tính kháng khuẩn của flavonoid
• Hoạt tính kháng khuẩn
• Lá chè xanh và trầu không
• Hợp chất flavonoid