tailieunhanh - Đa dạng di truyền gen ORF5 của một số chủng virus PRRS phân lập từ năm 2011 đến năn 2013 tại miền Bắc Việt Nam

Hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp ở lợn (PRRS) là một trong những nguyên nhân gây thiệt hại kinh tế quan trọng cho ngành chăn nuôi lợn ở Việt Nam. Việc phân tích về đa dạng di truyền của các chủng virus PRRS phân lập được ngoài thực địa đóng vai trò quan trọng trong việc xây dựng chiến lược phòng chống bệnh. Trong nghiên cứu này, 6 chủng virus PRRS đã được phân lập từ các mẫu bệnh phẩm thu thập được ngoài thực địa trong giai đoạn 2011 – 2013 và được giải trình tự và phân tích vùng gen ORF5. | KHOA HỌC KỸ THUẬT THÚ Y TẬP XXIII SỐ 1 - 2016 ÑA DAÏNG DI TRUYEÀN GEN ORF5 CUÛA MOÄT SOÁ CHUÛNG VIRUS PRRS PHAÂN LAÄP TÖØ NAÊM 2011 ÑEÁN NAÊM 2013 TAÏI MIEÀN BAÉC VIEÄT NAM Đỗ Hải Quỳnh1, Vũ Thị Thu Hằng2, Thân Đức Dương2, Nguyễn Bá Hiên1, Lê Văn Phan1* TÓM TẮT Hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp ở lợn (PRRS) là một trong những nguyên nhân gây thiệt hại kinh tế quan trọng cho ngành chăn nuôi lợn ở Việt Nam. Việc phân tích về đa dạng di truyền của các chủng virus PRRS phân lập được ngoài thực địa đóng vai trò quan trọng trong việc xây dựng chiến lược phòng chống bệnh. Trong nghiên cứu này, 6 chủng virus PRRS đã được phân lập từ các mẫu bệnh phẩm thu thập được ngoài thực địa trong giai đoạn 2011 – 2013 và được giải trình tự và phân tích vùng gen ORF5. Kết quả phân tích về trình tự nucleotide (nt) và và amino acid (aa) của gen ORF5 cho thấy cả 6 chủng virus có mức độ tương đồng với nhau rất cao, tỷ lệ tương đồng về nt là 96,5 – 99,8% và về aa là 94,0 – 99,5%. Kết quả phân tích về cây phả hệ cho thấy cả 6 chủng virus đều thuộc dòng (type) Bắc Mỹ, nhánh (sub-lineage) . Từ khóa: Hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp ở lợn, Đa dạng di truyền, ORF5, Miền Bắc Việt Nam Genetic variation of ORF5 gene of some Porcine reproductive and respiratory syndrome viruses isolated from 2011 to 2013 in the North of Viet Nam Do Hai Quynh, Vu Thi Thu Hang, Than Duc Duong, Nguyen Ba Hien, Le Van Phan SUMMARY Porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) is one of the diseases causing heavy loss in the swine industry in Viet Nam. The evaluation of the genetic diversity of PRRSV strains plays an important role in developing disease prevention strategies. In this study, the ORF5 gene of 6 field PRRS viruses isolated in Viet Nam during 2011 – 2013 was sequenced and analyzed. The result of nucleotide (nt) and amino acid (aa) comparison showed that 6 field PRRS viruses were closely related to each other, sharing high similarity level ( – ) on nt and ( – ) on aa.