tailieunhanh - Phát hiện vi khuẩn Aeromonas schubertii gây đốm trắng ở nội quan cá lóc (Channa striata) bằng phương pháp PCR

Bài viết Phát hiện vi khuẩn Aeromonas schubertii gây đốm trắng ở nội quan cá lóc (Channa striata) bằng phương pháp PCR trình bày quy trình PCR phát hiện vi khuẩn Aeromonas schubertii gây bệnh đốm trắng nội quan trên cá lóc được thực hiện và chuẩn hóa. Cặp mồi Schubertii-16S- (UF-2) F và Schubertii-16S- (UF-2) R (Demarta et al., 1999) được sử dụng để khuếch đại gen 16s rDNA cho vi khuẩn A,. . | Tạp chí Khoa học Trường Đại học Cần Thơ Tập 53, Phần B (2017): 32-40 DOI: PHÁT HIỆN VI KHUẨN Aeromonas schubertii GÂY ĐỐM TRẮNG Ở NỘI QUAN CÁ LÓC (Channa striata) BẰNG PHƯƠNG PHÁP PCR Nguyễn Ngọc Dung và Đặng Thị Hoàng Oanh Khoa Thủy sản, Trường Đại học Cần Thơ Thông tin chung: Ngày nhận bài: 15/05/2017 Ngày nhận bài sửa: 12/07/2017 Ngày duyệt đăng: 30/11/2017 Title: Detection of Aeromonas schubertii causing white inclusions in internal organs of snakehead fish (Channa striata) by using polymerase chain reaction Từ khóa: Aeromonas schubertii, Cá lóc (Channa striata), PCR Keywords: Aeromonas schubertii, PCR and snakehead fish (Channa striata) ABSTRACT The PCR procedure to detect Aeromonas schubertii bacteria, which causes white inclusions in internal organs of snakehead fish, was carried out and standardized. The primer pairs Schubertii-16S- (UF-2) F and Schubertii-16S- (UF-2) R (Demarta et al., 1999) were used to amplify the 16s rDNA gene for A. schubertii with a 322-bp PCR product was used in order to shorten the detection time and specific to the causative agent. The optimized PCR procedure includes 1 mM MgCl 2, 1U Taq DNA polymerase and mM dNTPs. The detection limit of this PCR protocol is approximately of 30 ng DNA. The specificity of the primer pair is determined to detect only A. schubertii bacteria without detection of some common bacterial pathogens in aquaculture such as Streptococcus agalactiae, Aeromonas hydrophila, Vibrio parahaemolyticus, Edwardsiella ictaluri and Flavobactertium columnare. TÓM TẮT Quy trình PCR phát hiện vi khuẩn Aeromonas schubertii gây bệnh đốm trắng nội quan trên cá lóc được thực hiện và chuẩn hóa. Cặp mồi Schubertii-16S- (UF-2) F và Schubertii-16S- (UF-2) R (Demarta et al., 1999) được sử dụng để khuếch đại gen 16s rDNA cho vi khuẩn A. schubertii với kích thước sản phẩm PCR là 322 bp được thực hiện nhằm rút ngắn thời gian và phát hiện chính xác tác nhân gây bệnh. Quy trình PCR được chuẩn hóa có .