tailieunhanh - Bước đầu xác định porcine deltacoronavirus (PDCoV) gây tiêu chảy ở lợn nuôi tại thành phố Hà Nội và tỉnh Thái Bình

Mục tiêu nghiên cứu của bài viết nhằm xác định sự có mặt của PDCoV trong các vụ dịch tiêu chảy trên lợn xảy ra tại Thái Bình và Hà Nội năm 2015, làm cơ sở cho những chẩn đoán sau này về việc xác định vai trò của PDCoV gây tiêu chảy ở lợn cũng như các biện pháp phòng bệnh hiệu quả bằng vacxin. | Vietnam J. Agri. Sci. 2017 Vol. 15 No. 2 171-177 Tạp chí Khoa học Nông nghiệp Việt Nam 2017 tập 15 số 2 171-177 Bưỡc ĐẦU XÁC ĐỊNH PORCINE DELTACORONAVIRUS PDCoV GÂY TIÊU CHẢY d LỢN NUÔI TẠI THÀNH PHỐ HÀ NỘI VÀ TỈNH THÁI BÌNH Lê Văn Phan1 Cao Thị Bích Phượng1 Đồng Văn Hiếu1 Lê Đình Quyền2 Phạm Ngọc Thạch1 IKhoa Thúy Học viện Nông nghiệp Việt Nam 2Công ty cổ phần Phát triển công nghệ nông thôn RTD Email letranphan@ Ngày gửi bài Ngày chấp nhận TÓM TẮT Trong nghiên cứu này kỹ thuật RT-PCR và giải trình tự gen đã được sử dụng để xác định sự có mặt của porcine deltacoronavirus PDCoV trong 18 mẫu bệnh phẩm gồm phân và ruột của lợn mắc bệnh tiêu chảy thu thập được năm 2015 tại 4 trang trại lợn nuôi tại Hà Nội và Thái Bình. Kết quả chẩn đoán cho thấy 15 18 83 33 mẫu bệnh phẩm cho kết quả dương tính với PDCoV. Kết quả phân tích về trình tự nucleotide và trên cơ sở giải mã trình tự đoạn gen nucleocapsid của PDCoV cho thấy chủng virus PDCoV VN TBI 2015 trong nghiên cứu này có mức độ tương đồng về trình tự nucleotide là 99 và amino acid là 99 5 khi so sánh với chủng virus VN-1215 tham chiếu phân lập được cùng năm 2015 tại Đồng Nai. Kết quả phân tích về cây phả hệ cho thấy chủng virus PDCoV VN TBI 2015 thu thập được ờ Thái Bình và chủng virus VN-1215 phân lập được ờ Đồng Nai năm 2015 nằm trên cùng một nhánh trên cây phả hệ và gần gũi với các chủng PDCoV phân lập được tại Hồng Kông năm 2012 và Trung Quốc năm 2014. Từ khóa Porcine deltacoronavirus tiêu chảy lợn RT-PCR. Preliminary Identification of Porcine Deltacoronavirus PDCoV from Pigs in Hanoi and Thai Binh ABSTRACT Reverse transcription - polymerase chain reaction RT-PCR and sequencing methods were used to identify porcine deltacoronavirus PDCoV in eighteen fecal and intestine samples of diarrhae piglets in four farms in Thai Binh and Hanoi in 2015. The diagnostic results showed that 15 18 samples were possitive with PDCoV. The nucleotide and deduced amino acid analysis .