tailieunhanh - Đặc điểm phân bố các subtype HIV-1 tại Việt Nam

Bài viết nghiên cứu xác định các subtype HIV-1 bằng PCR đa mồi và giải trình tự của 720 mẫu trên các khu vực nghiên cứu, xác định được subtype của 679 mẫu, trong đó, chủ yếu là subtype CRF01-AE (98,53%), subtype B (1,33%), subtype CRF25_CPX (0,15%). Không xác định được subtype của 41 mẫu (5,69%). Sử dụng phương pháp PCR đa mồi đã tối ưu nhằm xác định các subtype HIV-1 tại Việt Nam có giá trị tương đương với phương pháp giải trình tự. | TẠP CHÍ Y - DƢỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 5-2013 ĐẶC ĐIỂM PHÂN BỐ CÁC SUBTÝP HIV-1 TẠI VIỆT NAM Phạm Đức Minh*; Đặng Xuân Kiên*; Trần Văn Tuấn* TrÇn ThÞ Oanh**; Lê Bách Quang* TÓM TẮT Nghiên cứu xác định các subtýp HIV-1 bằng PCR đa mồi và giải trình tự của 720 mẫu trên các khu vực nghiên cứu, xác định đƣợc subtýp của 679 mẫu, trong đó, chủ yếu là subtýp CRF01-AE (98,53%), subtýp B (1,33%), subtýp CRF25_CPX (0,15%). Không xác định đƣợc subtýp của 41 mẫu (5,69%). Sử dụng phƣơng pháp PCR đa mồi đã tối ƣu nhằm xác định các subtýp HIV-1 tại Việt Nam có giá trị tƣơng đƣơng với phƣơng pháp giải trình tự. * Từ khóa: HIV-1; Phƣơng pháp PCR đa mồi; Subtýp HIV; Ph©n bè. CHARACTERISTICS OF DISTRIBUTION OF SUBTyPe HIV-1 IN VIETNAM Summary The study identified the HIV-1 subtypes by mPCR and sequencing of 720 samples in the study area, the results showed the subtype of the 679 samples, which mainly subtype CRF01-AE (), subtype B (), subtype CRF25_CPX (). The subtype of 41 samples () can not be identified. Optimal mPCR methods was used for identification of HIV-1 subtype in Vietnam which is equivalent to the sequencing method. * Key words: HIV-1; mPCR; HIV subtype; Distribution. ĐẶT VẤN ĐỀ HIV có 2 týp là HIV-1 và HIV-2, cả hai týp này đều lây truyền qua đƣờng tình dục, đƣờng máu và từ mẹ sang con. Riêng HIV1 có tính đa dạng di truyền cao và dễ dàng lây lan nhanh trong cộng đồng. Các chủng của HIV-1 đƣợc phân thành 4 nhóm: M, N, O, P, trong đó, nhóm M chiếm đa số, đƣợc chia thành 10 phân týp, bao gồm: phân týp A, B, C, D, E, F, G, H, J và K và 49 dạng tái tổ hợp (CRFs) [7] của các phân týp trên. Phân týp phân bố mang tính trội cho từng vùng địa lý khác nhau, mỗi phân týp lại có tính trội theo đƣờng lây truyền nhất định. Ví dụ, ở Thái Lan, phân týp B trội ở những đối tƣợng tiêm chích ma túy, phân týp E trội ở trƣờng hợp lây nhiễm qua đƣờng tình dục [6, 7]. Nghiên cứu sự phân bố các phân týp và dạng tái tổ hợp của HIV-1 có giá trị trong giám sát dịch tễ học ở tầm .