tailieunhanh - Đặc trưng phân tử nấm Mycosphaerella berkeleyi gây bệnh đốm đen lạc tại Nghệ An

Đặc trưng phân tử nấm Mycosphaerella berkeleyi gây bệnh đốm đen lạc tại Nghệ An trình bày: Phân tích Rep-PCR đã chứng tỏ quần thể nấm đốm đen không đa dạng về di truyền. Không có mối quan hệ giữa các nhóm nấm được xác định dựa trên phân tích Rep-PCR và nguồn gốc thu thập mẫu cũng như đặc điểm hình thái,. . | Vietnam J. Agri. Sci. 2016, Vol. 14, No. 9: 1312-1322 Tạp chí KH Nông nghiệp Việt Nam 2016, tập 14, số 9: 1312-1322 ĐẶC TRƯNG PHÂN TỬ NẤM Mycosphaerella berkeleyi GÂY BỆNH ĐỐM ĐEN LẠC TẠI NGHỆ AN Ngô Thị Mai Vi 1*, Hà Giang2, Trần Thị Như Hoa2, Nguyễn Văn Viên3 1 2 Khoa Nông lâm ngư, Trường đại học Vinh Trung tâm Nghiên cứu Bệnh cây Nhiệt đới, Học viện Nông nghiệp Việt Nam 3 Khoa Nông học, Học viện Nông nghiệp Việt Nam Email*: maivitpv@ Ngày gửi bài: Ngày chấp nhận: TÓM TẮT Nghiên cứu này đã lần đầu tiên xác định được trình tự vùng ITS (Internal Transcribed Spacer) của 11 mẫu nấm đốm đen thu thập trên lạc năm 2013, chủ yếu tại tỉnh Nghệ An. Trình tự gen ITS của tất cả các mẫu nấm đều đồng nhất 100% với nhau và đồng nhất từ 99,7 - 100% với loài Mycosphaerella berkeleyi trên GenBank. Kỹ thuật PCR dùng mồi thiết kế trên các chuỗi lặp (Rep-PCR, repetitive sequence primed PCR) với 3 bộ mồi được thiết kế trên các chuỗi lặp của vi khuẩn gồm chuỗi lặp đối song vùng không mã hóa (REP, repetitive extragenic palindromic), chuỗi lặp bảo thủ vùng liên gen (ERIC, enterobacterial repetitive intergenic consensus) và chuỗi BOX cũng đã được sử dụng để đánh giá mức độ đa dạng di truyền của 33 mẫu nấm đốm đen thu thập trên lạc, chủ yếu tại tỉnh Nghệ An. Phản ứng PCR dùng bộ mồi BOX đã tạo nhiều băng sản phẩm đa hình. Phân tích Rep-PCR đã chứng tỏ quần thể nấm đốm đen không đa dạng về di truyền. Không có mối quan hệ giữa các nhóm nấm được xác định dựa trên phân tích Rep-PCR và nguồn gốc thu thập mẫu cũng như đặc điểm hình thái. Từ khóa: Mycosphaerella berkeleyi, đốm đen lạc, Nghệ An, Việt Nam, Rep-PCR, ITS. Molecular Characterization of Mycosphaerella Berkeleyi Causing Late Leaf Spot of Groundnut in Nghe An ABSTRACT This study identified the ITS (Internal Transcribed Spacer) sequence of 11 groundnut late leaf spot fungal isolates collected from Vietnam, mainly from Nghe An province in 2013. The ITS sequences of the 11 isolates .