tailieunhanh - Thiết kế mồi chuyên biệt để nhận diện vi tảo nhóm Thraustochytrid

. Trong nghiên cứu này, chín dòng vi tảo này đã được xác định thuộc chi Thraustochytrium và Schizochytrium sử dụng hai cặp mồi được thiết kế dựa trên trình tự vùng gen 18S rDNA của một số loài vi tảo mục tiêu. Trong đó, 2 dòng vi tảo là M19 và D14 thuộc chi Thraustochytrium và 7 dòng còn lại thuộc Schizochytrium dựa vào việc so sánh kết quả phản ứng chuỗi trùng hợp với cặp mồi nhận diện Schizochytrium. | TẠP CHÍ KHOA HỌC & CÔNG NGHỆ NÔNG NGHIỆP ISSN 2588-1256 Tập 2(1) - 2018 THIẾT KẾ MỒI CHUYÊN BIỆT ĐỂ NHẬN DIỆN VI TẢO NHÓM THRAUSTOCHYTRID Nguyễn Lam Minh, Trần Thị Xuân Mai, Nguyễn Thị Liên Viện Nghiên cứu và Phát triển Công nghệ Sinh học, Đại học Cần Thơ Liên hệ: lamminh09011992@ TÓM TẮT Việc nhận diện nhóm vi tảo biển dị dưỡng thraustochytrid bằng phương pháp truyền thống còn gặp nhiều khó khăn. Bằng quan sát hình thái dưới kính hiển vi quang học, chín dòng vi tảo được cung cấp bước đầu được xác định là thuộc nhóm thraustochytrid. Trong nghiên cứu này, chín dòng vi tảo này đã được xác định thuộc chi Thraustochytrium và Schizochytrium sử dụng hai cặp mồi được thiết kế dựa trên trình tự vùng gen 18S rDNA của một số loài vi tảo mục tiêu. Trong đó, 2 dòng vi tảo là M19 và D14 thuộc chi Thraustochytrium và 7 dòng còn lại thuộc Schizochytrium dựa vào việc so sánh kết quả phản ứng chuỗi trùng hợp với cặp mồi nhận diện Schizochytrium. Ngoài ra, 3 dòng vi tảo được giải trình tự bằng cặp mồi Thraus-Schi1 với kích thước khoảng bp là B3, M6 và D14. Dựa vào phân tích cây phả hệ và kết quả tìm kiếm trình tự tương đồng từ ngân hàng gen NCBI (National Center for Biotechnology Information), dòng B3 và M6 thuộc chi Schizochytrium và Aurantiochytrium (trong đó dòng B3 đồng hình cao với Schizochytrium sp. SKA10 ở mức độ 79% và dòng M6 ở mức 98% với Schizochytrium sp. KRT1), và dòng D14 thuộc chi Thraustochytrium, đồng hình ở mức 93% với Thraustochytrium sp. . Các cặp mồi được thiết kế trong nghiên cứu này đã giúp nhận diện nhanh các dòng vi tảo thuộc thraustochytrid. Từ khóa: Acid béo không no, Schizochytrium, Thraustochytrium, vi tảo dị dưỡng Nhận bài: 28/12/2017 Hoàn thành phản biện: 24/01/2018 Chấp nhận bài: 26/01/2018 1. MỞ ĐẦU Thraustochytrid là nhóm vi tảo biển dị dưỡng phổ biến, được biết đến như là nguồn cung cấp dồi dào các hợp chất hoạt động sinh học có giá trị. Chúng thường được tìm thấy ở các hồ nước mặn cũng như ở vùng biển và vùng nước lợ .