tailieunhanh - Nghiên cứu trình tự đoạn DNA chỉ thị trên gen ribosome 18s của một số loài hải miên tại khu bảo tồn biển đảo Cồn Cỏ, tỉnh Quảng Trị

Trong nghiên cứu này, đoạn DNA kích thước 559-561 bp trên gen ribosome 18S được phân lập từ 6 mẫu hải miên Biemna variantia, Niphates sp., Erylus sp., Mycale laevis, Dictyonella pelligera và Hyrtios erectus thu thập tại khu bảo tồn biển Đảo Cồn Cỏ. | TAP CHI SINH HOC 2014, 36(1): 65-72 Nghiên DOI: cứu trình tự ñoạn DNA chỉ thị NGHIÊN CỨU TRÌNH TỰ ĐOẠN DNA CHỈ THỊ TRÊN GEN RIBOSOME 18S CỦA MỘT SỐ LOÀI HẢI MIÊN (Porifera: Demospongiae) TẠI KHU BẢO TỒN BIỂN ĐẢO CỒN CỎ, TỈNH QUẢNG TRỊ Trần Mỹ Linh1*, Nguyễn Chi Mai2, Lê Quang Trung2, Vũ Hương Giang1, Lê Quỳnh Liên1, Lê Thành Long2, Phan Minh Tuấn2, Nguyễn Tường Vân3, Ninh Khắc Bản1 1 Viện Hóa sinh biển, Viện Hàn lâm KH & CN Việt Nam, *tmlinh@ 2 Trung tâm Phát triển công nghệ cao, Viện Hàn lâm KH & CN Việt Nam 3 Viện Công nghệ sinh học, Viện Hàn lâm KH & CN Việt Nam TÓM TẮT: Rất ít công trình nghiên cứu về hải miên ở vùng biển Việt Nam liên quan tới thành phần loài, phân bố và tiềm năng sử dụng, ñặc biệt, chưa có nghiên cứu nào ở mức ñộ sinh học phân tử. Các chỉ thị phân tử như gen ribosome 18S và 28S ñã ñược lựa chọn ñể phân tích sự phát sinh chủng loại, phân loại và ña dạng sinh học của hải miên. Trong nghiên cứu này, ñoạn DNA kích thước 559-561 bp trên gen ribosome 18S ñược phân lập từ 6 mẫu hải miên Biemna variantia, Niphates sp., Erylus sp., Mycale laevis, Dictyonella pelligera và Hyrtios erectus thu thập tại khu bảo tồn biển Đảo Cồn Cỏ. Kết quả phân tích trình tự nucleotide của các ñoạn rDNA 18S cho thấy 6 mẫu hải miên có ñộ tương ñồng từ 88,2-96,8% và từ 99,3-100% giữa mẫu hải miên với trình tự thuộc loài tương ứng ñã ñăng ký trên Ngân hàng Gen quốc tế, ñồng thời thể hiện sự ña hình nucleotide giữa các loài nghiên cứu với 96 ñiểm sai khác. Từ khóa: Hải miên, chỉ thị phân tử, rDNA 18S, ñảo Cồn Cỏ. MỞ ĐẦU Ngành ñộng vật Thân lỗ (Porifera), hay thường gọi là hải miên, là một trong những loài ñộng vật biển có sự ña dạng cao [12]. Hải miên cũng là nhóm sinh vật biển rất có giá trị do chứa nhiều hợp chất mới mang các hoạt tính sinh học liên quan tới y-dược như hoạt tính kháng sinh, ức chế thần kinh hay miễn dịch, giảm ñau, kháng u và kháng virus [4]. Van et al. (2013) [12] ñã ghi nhận khoảng hơn loài hải miên, .