tailieunhanh - Thiết lập phản ứng multiplex PCR phục vụ nghiên cứu cá chim vây vàng (trachinotus spp.)

Trong nghiên cứu này, 15 chỉ thị microsatellite cho cá chim vây vàng (Trachinotus spp.) từ các nghiên cứu trước được chọn lọc để tối ưu quy trình nhằm phục vụ phân tích đa dạng di truyền. Bảy chỉ thị đơn đã được tối ưu thành công trên cá chim vây vàng vây ngắn và 4 chỉ thị được tối ưu trên cá chim vây vàng vây dài. Từ đó, ba phản ứng multiplex PCR được phát triển từ chín mồi đơn. | Tạp chí Khoa học Nông nghiệp Việt Nam 2018, 16(3): 232-240 Vietnam J. Agri. Sci. 2018, Vol. 16, No. 3: 232-240 THIẾT LẬP PHẢN ỨNG MULTIPLEX PCR PHỤC VỤ NGHIÊN CỨU CÁ CHIM VÂY VÀNG (Trachinotus spp.) Lưu Thị Hà Giang1, Đặng Thị Nguyên2, Trần Thị Thúy Hà1*, Phan Thị Vân1 Viện nghiên cứu nuôi trồng thủy sản 1 Khoa Công nghệ sinh học, Học viện Nông nghiệp Việt Nam 1 2 Email*: thuyha@ Ngày gửi bài: Ngày chấp nhận: TÓM TẮT Trong nghiên cứu này, 15 chỉ thị microsatellite cho cá chim vây vàng (Trachinotus spp.) từ các nghiên cứu trước được chọn lọc để tối ưu quy trình nhằm phục vụ phân tích đa dạng di truyền. Bảy chỉ thị đơn đã được tối ưu thành công trên cá chim vây vàng vây ngắn và 4 chỉ thị được tối ưu trên cá chim vây vàng vây dài. Từ đó, ba phản ứng multiplex PCR được phát triển từ chín mồi đơn. Trong đó, lựa chọn được 02 tổ hợp cho cá chim vây vàng ngắn và 01 tổ hợp cho cá chim vây vàng dài. Quy trình phân tích đoạn với ba bộ chỉ thị microsatellite tương ứng với chín locus được xây dựng. Kết quả phân tích đoạn cho thấy 8 locus (EC-7; EC-9; EC-10; EC-17; EC-20; EC-28; TB018; TBG030) thể hiện tính đa hình với số alen dao động từ 3 - 6, riêng locus TO67 không thể hiện tính đa hình. Kết quả này có ý nghĩa khoa học trong việc nghiên cứu đa dạng di truyền cá chim vây vàng (Trachinotus spp.) Từ khóa: Cá chim vây vàng, microsatellite, PCR đa mồi, phân tích đoạn. Optimizaton and Evaluation Multiplex PCR for Analysis of Pompano (Trachinotus spp.) ABSTRACT In this study, fifteen microsatellite markers were used to optimize a protocol for analyzing genetic diversity of pompano (Trachinotus spp.). Seven single markers were successfully optimized for short fin Pompano and four markers were optimized for long fin Pompano. Three multiplex PCR reactions including two multiplex pools for short fin Pompano and one pool for long fin Pompano were developed which composed of nine fluorescent-labeled markers. Fragment analysis process .