tailieunhanh - Báo cáo "Phát triển chỉ thị STS dựa trên các phân đoạn AFLP liên kết với một số tính trạng hình thái rễ trong chọn dòng lúa chịu hạn "

Phát triển chỉ thị STS dựa trên các phân đoạn AFLP liên kết với một số tính trạng hình thái rễ trong chọn dòng lúa chịu hạn | Tạp chí Công nghệ Sinh học 7 3 349-355 2009 PHÁT TRIỀN CHỈ THỊ STS DựẠ TRÊN CÁC PHÂN ĐOẠN AFLP LIÊN KẾT VỚI MỘT SỐ TÍNH TRẠNG HÌNH THÁI RỄ TRONG CHỌN DÒNG LÚA CHỊU HẠN Nguyễn Thị Kim Liên Nguyễn Thúy Hạnh Trần Quốc Trọng Phạm Quang Chung Nguyễn Đức Thành Viện Công nghệ sinh học TÓM TẮT Phương pháp chọn lọc nhờ sự trợ giúp của các chỉ thị phân từ MAS - Marker Assisted Selection là một phương pháp chọn giống hiện đại đang được áp dụng rộng rãi hiện nay. Dựa vào vị trí chính xác các gen trên bản đồ và mối liên kết chặt giữa các chỉ thị với gen được quan tâm có thể đánh giá kiểu gen của các cá thể trong quần thể. Các chỉ thị phân tử RAPD AFLP RFLP được sử dụng trong lập bản đồ liên kết nhưng không thể trực tiếp trong chọn giống mà cần phát triển thành các chỉ thị STS mới có thể sử dụng. Đe có thể ứng dụng MAS cần phát triển rất nhiều các chỉ thị STS mang tính đặc trung và dễ sử dụng liên kết chặt với gen kiểm soát các tính trạng đang được quan tâm. Từ các kết quả đạt được trong việc xây dựng bàn đồ QTL bằng các chỉ thị AFLP liên kết với một số tính trạng hình thái rễ liên quan đến tính chịu hạn trước đây chúng tôi đã phát triển chi thị STS từ các phân đoạn AFLP liên kết nhằm ứng dụng chúng trong chọn dòng lúa chịu hạn. Chúng tôi đã phân lập và đọc trình tự của sáu phân đoạn AFLP liên kết với tính trạng số lượng rễ đường kính rễ độ dài rễ tỷ lệ khối lượng rễ thân và tỷ lệ khối lượng rễ sâu thân. Dựa trên trình tự đọc được chúng tôi đã thiết kế sáu cặp moi STS. Chúng tôi đã tìm được điều kiện thích họp cho các cặp mồi STSAVM62 STSAVM22 và STSAVM87 với nhiệt độ bắt cặp tương ứng là 54 53 và 60 C. Tuy nhiên sản phẩm PCR chưa có sự đa hình. Vì vậy để tạo ra sự đa hình giữa các dòng chúng tôi đã tiến hành nhân PCR với mồi STS đơn. Kết quả bước đàu khi nhân PCR với moi STSAVM62 ngược đã thu được phân đoạn DNA đa hình giữa các dòng ở vị trí 1000 bp. Với tính ồn định cao trong quần thể qua các thế hệ phân đoạn DNA thu được có thể sử dụng trong chọn dòng lúa chịu hạn sau khi có