tailieunhanh - KHẢO SÁT SỰ LƯU HÀNH VÀ BƯỚC ĐẦU GIẢI TRÌNH TỰ GENE CỦA VIRUS CÚM GIA CẦM SUBTYPE H5N1 TẠI TỈNH CÀ MAU VÀ SÓC TRĂNG

Đề tài được thực hiện nhằm khảo sát sự lưu hành của virus cúm gia cầm và bước đầu nghiên cứu trình tự gene HA (H5) và NA (N1) của một số chủng virus cúm gia cầm, subtype H5N1 tại tỉnh Cà Mau và Sóc Trăng. Bằng kỹ thuật Realtime RT-PCR đã giúp phát hiện sự lưu hành của virus cúm gia cầm và với kỹ thuật giải mã gene đã bước đầu giải mã gene các chủng virus cúm gia cầm ở tỉnh Cà Mau và Sóc Trăng. Ở tỉnh Sóc Trăng có sự lưu hành của virus cúm gia cầm subtype H5 với. | Tạp chí Khoa học 2011 20a 7-17 Trường Đại học Cần Thơ KHẢO SÁT SỰ LƯU HÀNH VÀ BƯỚC ĐẦU GIẢI TRÌNH TỰ GENE CỦA VIRUS CÚM GIA CẦM SUBTYPE H5N1 TẠI TỈNH CÀ MAU VÀ SÓC TRĂNG Dương Thị Thanh Thảo và Lý Thị Liên Khai 1 ABSTRACT This study was conducted to survey the Avian Influenza AI outbreak virus circulation and initialized to analysis 2 gene segments such as HA H5 and NA N1 of AI virus H5N1 at Ca Mau and Soc Trang provinces. They were amplified by Realtime RT-PCR and sequenced. The prevalence of AI virus subtype H5 in Soc Trang was only in ducks and was not detected AI virus subtype N1. The prevalence of AI virus subtype H5 in Ca Mau was not detected. A total of 4 H5N1 samples at two provinces were isolated and their genome sequenced. Homology between two gene segments of 4 samples were evaluated by sequence comparision. By compairing with H5 N1 gene segments isolated in Vietnam and Asia countries they were showed that homologous nucleotide and amino acid reached 92 - 98 in H5 gene segment and 92 - 99 91 - 99 in N1 gene segment respectively. It was noteworthy that full-length H5 N1 gene segments were closely related to Guangdong strain which had origined from China. Keywords Avian Influenza H5N1 gene Title The prevalence of Avian influenza virus and initialized analysis gene segments such as HA H5 of AI virus H5N1 at Ca Mau and Soc Trang provinces TÓM TẮT Đề tài được thực hiện nhằm khảo sát sự lưu hành của virus cúm gia cầm và bước đầu nghiên cứu trình tự gene HA H5 và NA N1 của một số chủng virus cúm gia cầm subtype H5N1 tại tỉnh Cà Mau và Sóc Trăng. Bằng kỹ thuật Realtime RT-PCR đã giúp phát hiện sự lưu hành của virus cúm gia cầm và với kỹ thuật giải mã gene đã bước đầu giải mã gene các chủng virus cúm gia cầm ở tỉnh Cà Mau và Sóc Trăng. Ở tỉnh Sóc Trăng có sự lưu hành của virus cúm gia cầm subtype H5 với tỷ lệ 1 67 xảy ra chủ yếu là trên vịt không phát hiện sự lưu hành của subtype N1. Ở tỉnh Cà Mau không phát hiện sự lưu hành của virus cúm gia cầm subtype .