tailieunhanh - CHUẨN HÓA QUI TRÌNH PCR PHÁT HIỆN VI KHUẨN EDWARDSIELLA ICTALURI, AEROMONAS HYDROPHILA VÀ FLAVOBACTERIUM COLUMNARE TỪ MÁU CÁ TRA (PANGASIANODON HYPOPHTHALMUS)

Qui trình chiết tách DNA từ máu cá tra và các qui trình PCR phát hiện các loài vi khuẩn Edwardsiella ictaluri, Aeromonas hydrophila và Flavobacterium columnare được chuẩn hóa và ứng dụng. Qui trình PCR phát hiện E. ictaluri cho sản phẩm PCR đặc hiệu là 407 bp với độ nhạy phát hiện là CFU/ml vi khuẩn trong 100 l máu cá. Qui trình PCR phát hiện A. hydrophila cho sản phẩm PCR đặc hiệu là 209 bp với độ nhạy phát hiện là CFU/ml vi khuẩn trong 100 l máu cá. Qui trình PCR phát hiện F. columnare cho sản phẩm PCR. | Tạp chí Khoa học 2012 21b 179-187 Trường Đại học Cần Thơ CHUẨN HÓA QUI TRÌNH PCR PHÁT HIỆN VI KHUẨN EDWARDSIELLAICTALURI AEROMONAS HYDROPHILA VÀ FLAVOBACTERIUM COLUMNARE TỪ MÁU CÁ TRA PANGASIANODON HYPOPHTHALMUS Trần Nguyễn Diễm Tú1 và Đặng Thị Hoàng Oanh1 ABSTRACT Protocolfor DNA extraction from blood of stripped catfish and PCR protocolsfor detection of Edwardsiella ictaluri Aeromonas hydrophila and Flavobacterium columnare bacteria were optimized and applied. The optimized PCR protocol for detection of E. ictaluri bacteria gave a PCR product of407 bp and detection sensitivity was CFU ml of bacteria in 100 ul catfish blood. The optimized PCR protocol for detection of A. hydrophila bacteria gave a PCR product of 209 bp and detection sensitivity was CFU ml of bacteria in 100 ul catfish blood. The optimized PCR protocol for detection of F. columnare bacteria gave a PCR product of 504 bp and detection sensitivity was CFU ml of bacteria in 100 ul catfish blood. These PCR protocols were used to detect respective bacteria in blood samples of experimental injection catfish. The obtained results showed that optimized PCR protocols can be used as a non destructive methodsfor rapid sensitive and specific detection of bacterial infection in catfish. Keywords Edwardsiella ictaluri Aeromonas hydrophila Flavobacterium columnare pCr. Fish blood Title Optimization of PCR protocols for detection of Edwardsiella ictaluri Aeromonas hydrophila and Flavobacterium columnare bacteria from stripped catfish blood TÓM TẮT Qui trình chiết tách DNA từ máu cá tra và các qui trình PCR phát hiện các loài vi khuẩn Edwardsiella ictaluri Aeromonas hydrophila và Flavobacterium columnare được chuẩn hóa và ứng dụng. Qui trình PCR phát hiện E. ictaluri cho sản phẩm PCR đặc hiệu là 407 bp với độ nhạy phát hiện là CFU ml vi khuẩn trong 100 ul máu cá. Qui trình PCR phát hiện A. hydrophila cho sản phẩm PCR đặc hiệu là 209 bp với độ nhạy phát hiện là CFU ml vi khuẩn