tailieunhanh - BÁO CÁO " VỊ TRÍ PHÂN LOẠI CỦA CÁC CHỦNG CLOSTRIDIUM PERFRINGENS PHÂN LẬP TẠI VIỆT NAM DỰA VÀO TRÌNH TỰ GEN 16S rRNA "

Trình tự nucleotid đoạn 645bp trên 16S rRNA của 5 chủng phân lập từ dê, cừu mắc bệnh viêm ruột tiêu chảy tại Việt Nam có mức tương đồng cao (99,8-100%); trong đó trình tự gen 16S rRNA của 3 chủng: CD4 (typ D) phân lập từ miền Bắc, DKH (typ D) phân lập tại Khánh Hòa và CV58 (typ A) phân lập từ Ninh Thuận là hoàn toàn giống nhau (100%), | VỊ TRÍ PHÂN LOẠI CỦA CÁC CHỦNG CLOSTRIDIUM PERFRINGENS PHÂN LẬP TẠI VIỆT NAM DỰA VÀO TRÌNH TỰ gen 16S rRNA Lê Lập1 Lê Văn Sơn2 Võ Thành Thìn1 Lê Đình Hải1 và Nguyễn Viết Không3 TÓM TẮT Trình tự nucleotid đoạn 645bp trên 16S rRNA của 5 chủng phân lập từ dê cừu mắc bệnh viêm ruột tiêu chảy tại Việt Nam có mức tương đồng cao 99 8-100 trong đó trình tự gen 16S rRNA của 3 chủng CD4 typ D phân lập từ miền Bắc DKH typ D phân lập tại Khánh Hòa và CV58 typ A phân lập từ Ninh Thuận là hoàn toàn giống nhau 100 chứng tỏ gen này có độ bảo tồn và tương đồng rất cao giữa các chủng với typ độc tố khác nhau và ở các vùng địa lý khác nhau giữa các chủng còn lại CV58 CV135 và typ C sự khác biệt chỉ là 1 nucleotid hay độ tương đồng 99 8 . Khác biệt này có thể được xem là do đột biến điểm ngẫu nhiên như vậy có thể kết luận đoạn 645 bp mã hóa cho 16S rRNA của các chủng phân lập tại Việt Nam là giống nhau. Phân tích cây phả hệ dựa vào so sánh trình tự gen 16S rRNA của các loài trong giống Clostridium Collins và cs. 1994 Sasaki và cs. 2001 2002 các chủng phân lập tại Việt Nam có vị trí thuộc giống Clostridium cụm I Cluster I nhóm I-a Clade I-a loài . Từ khóa Dê cừu Clostridium perfringens Giải trình tự gen 16S rRNA Vị trí phân loại Việt Nam PHYLOGENTIC POSITIONS OF CLOSTRIDIUM PERFRINGENS STRAINS ISOLATED FROM VIETNAM BASED ON 16S rRNA GEN SEQUENCES Le Lap Le Van Son Vo Thanh Thin Le Dinh Hai and Nguyen Viet Khong SUMMARY The nucleotide sequence of 645bp fragments on 16S rRNA of 5 strains isolated from diarrhea-enteritis goats and sheep reared in VietNam were completelly identical they were highly similarity 99 8-100 in which the 16S rRNA gen sequences of three strains CD4 type D isolated from the North DKH type D from Khanh Hoa và CV58 type A from Ninh Thuan were totally homologue 100 demontrated that these gens were highly conserve and homologue among strains of different toxinotypes and different isolated places among