tailieunhanh - BÁO CÁO " PHÂN TÍCH MỨC TƢƠNG ĐỒNG GENOME CỦA VI KHUẨN ESCHERICHIA COLI GÂY BỆNH Ở LỢN CON BẰNG PHƯƠNG PHÁP PFGE "

Mức tương đồng genome của 26 chủng vi khuẩn E. coli phân lập từ lợn con mắc bệnh tiêu chảy hoặc phù đầu tại một số địa phương của Việt Nam đã được xác định bằng phương pháp điện di xung điện trường (Pulsed-Field Gel Electrophoresis - PFGE). Mức độ tương đồng của các chủng mang kháng nguyên F4 cao hơn và có quan hệ gần hơn so với chủng mang kháng nguyên F18. Phương pháp PFGE có thể ứng dụng để phân tích đặc điểm dịch tễ và lựa chọn chủng vi khuẩn để nghiên cứu sản xuất. | PHÂN TÍCH MỨC TƯƠNG ĐỒNG GENOME CỦA VI KHUẨN ESCHERICHIA COLI GÂY BỆNH Ở LỢN CON BẰNG PHƯƠNG PHÁP PFGE Võ Thành Thìn Lê Lập Đặng Văn Tuấn Đặng Thanh Hiền Vũ Khắc Hùng Phân viện thú y miền Trung TÓM TẮT Mức tương đồng genome của 26 chủng vi khuẩn E. coli phân lập từ lợn con mắc bệnh tiêu chảy hoặc phù đầu tại một số địa phương của Việt Nam đã được xác định bằng phương pháp điện di xung điện trường Pulsed-Field Gel Electrophoresis - PFGE . Mức độ tương đồng của các chủng mang kháng nguyên F4 cao hơn và có quan hệ gần hơn so với chủng mang kháng nguyên F18. Phương pháp PFGE có thể ứng dụng để phân tích đặc điểm dịch tễ và lựa chọn chủng vi khuẩn để nghiên cứu sản xuất vacxin phòng bệnh tiêu chảy do E. coli gây ra ở lợn. Từ khóa Tương đồng genome Điện di xung điện trường Vi khuẩn E. coli Lợn cpn Tiêu chảy GENOMIC SIMILARITY ANALYSIS OF E. COLI STRAINS CAUSED DISEASE IN PIGLETS BY USING PFGE METHOD Vo Thanh Thin Le Lap Dang Van Tuan Dang Thanh Hien Vu Khac Hung SUMMARY Genome similarity level of 26 E. coli strains isolated from piglets with diarrhea or edema disease in some regions of Vietnam have been identified by means of PFGE Pulsed-Field Gel Electrophoresis . The similarity of the strains carried F4 fimbriae was higher and more closely related than strains bearing F18 fimbriae. The PFGE method might be applicable as a tool to analyze epidemiological characteristics and select strains for studying the vaccine production against diseases caused by E. coli in piglets. Key words Genome similarity Pulsed-field gel electrophoresis E. coli strains Piglets Diarrhea I. ĐẶT VẤN ĐỀ Cấu trúc kháng nguyên của vi khuẩn E. coli gây bệnh trên gia súc rất đa dạng và phức tạp với 4 nhóm kháng nguyên chính là các kháng nguyên O kháng nguyên thân H kháng nguyên lông K kháng nguyên giáp mô và F kháng nguyên bám dính Gyles và Fairbrother 2010 . Sự đa dạng về tính kháng nguyên này gây rất nhiều khó khăn cho công tác phòng chống bệnh trên gia súc. Vì thế việc đánh giá mức độ tương đồng .