tailieunhanh - BÁO CÁO "BƯỚC ĐẦU ĐÁNH GIÁ KHẢ NĂNG ỨNG DỤNG HỆ TRÌNH TỰ LẶP LẠI ĐƠN GIẢN (SSRs) TRONG NGHIÊN CỨU QUAN HỆ DI TRUYỀN GIỮA CÁC CHỦNG NẤM MỐC "

Nghiên cứu này được thực hiện nhằm tìm hiểu thành phần và mức độ đa hình của hệ trình tự lặp lại đơn giản (SSRs) ở Aspergillus oryzae để làm cơ sở cho việc ứng dụng chúng như những chỉ thị phân tử trong nghiên cứu quan hệ di truyền và kiểm định các chủng hoặc loài nấm mốc thuộc chi Aspergillus. Kết quả nghiên cứu bằng phần mềm tin sinh học đã cho thấy bộ gene nhân của Aspergillus oryzae chứa 841 trình tự SSR. . | J. Sci. Devel. Vol. 10 No. 7 1032-1043 Tạp chí Khoa học và Phát triển 2012. Tập 10 số 7 1032-1043 BƯỚC ĐẦU ĐÁNH GIÁ KHẢ NĂNG ỨNG DỤNG HỆ TRÌNH Tự LẶP LẠI ĐƠN GIẢN SSRs TRONG NGHIÊN CỨU QUAN HỆ DI TRUYỀN GIỮA CÁC CHỦNG NẤM mốc Aspergillus spp. Nguyễn Khắc Hải Đỗ Hải Quỳnh Bùi Thị Thanh Nguyễn Văn Thưởng Nguyễn Ngọc Hòa Nguyễn Ngọc Chỉnh Đặng Xuân Nghiêm Khoa Công nghệ Sinh học Trường Đại học Nông nghiệp Hà Nội Email dxnghiem@hua. edu. vn Ngày gửi bài Ngày chấp nhận TÓM TẮT Nghiên cứu này được thực hiện nhằm tìm hiểu thành phần và mức độ đa hình của hệ trình tự lặp lại đơn giản SSRs ở Aspergillus oryzae để làm cơ sở cho việc ứng dụng chúng như những chỉ thị phân tử trong nghiên cứu quan hệ di truyền và kiểm định các chủng hoặc loài nấm mốc thuộc chi Aspergillus. Kết quả nghiên cứu bằng phần mềm tin sinh học đã cho thấy bộ gene nhân của Aspergillus oryzae chứa 841 trình tự SSR. Mật độ các trình tự SSR trên 8 nhiễm sắc thể dao động trong khoảng từ 16 đến 26 SSR Mb. Các trình tự SSR có mức độ bảo thủ hoàn hảo 100 chiếm 44 6 trong tổng số 841 trình tự SSR có mức độ bảo thủ trên 70 . Việc nhân dòng thành công tất cả 17 locus SSR và iSSR inter-simple sequence repeat đã chỉ ra mức độ đa hình của chúng khá cao với khoảng 4 88 allele trên mỗi locus và chỉ số PIC trung bình đạt 0 6. Đặc biệt đa số các locus SSR đã được nhân dòng có số lượng và kích thước allele đặc trưng cho từng nhóm nấm mốc trong nghiên cứu. Kết quả này mở ra khả năng ứng dụng hệ trình tự SSR trong nghiên cứu quan hệ di truyền và kiểm định việc nhiễm những nấm mốc này trong thực phẩm và thức ăn chăn nuôi. Từ khóa Aspergillus oryzae Aspergillus spp. chỉ thị phân tử nấm mốc SSRs. Preliminary Evaluation of Potential Use of Simple Sequence Repeats SSRs in Studying Genetic Relationships among Isolates of Aspergillus spp. ABSTRACT This study is aimed at exploring simple sequence repeats SSRs arrays and their polymorphism in Aspergillus oryzae laying the foundations for the .