Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Giới thiệu
Đăng ký
Đăng nhập
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Thông tin
Điều khoản sử dụng
Quy định bảo mật
Quy chế hoạt động
Chính sách bản quyền
Giới thiệu
Đăng ký
Đăng nhập
0
Trang chủ
Luận Văn - Báo Cáo
Báo cáo khoa học
Báo cáo khoa học: Classification of the short-chain dehydrogenase ⁄reductase superfamily using hidden Markov models
Đang chuẩn bị liên kết để tải về tài liệu:
Báo cáo khoa học: Classification of the short-chain dehydrogenase ⁄reductase superfamily using hidden Markov models
Việt Hải
46
12
pdf
Đang chuẩn bị nút TẢI XUỐNG, xin hãy chờ
Tải xuống
The short-chain dehydrogenase⁄reductase (SDR) superfamily now has over 47 000 members, most of which are distantly related, with typically 20– 30% residue identity in pairwise comparisons, making it difficult to obtain an overview of this superfamily. | ỊFEBS Journal Classification of the short-chain dehydrogenase reductase superfamily using hidden Markov models Yvonne Kallberg1 2 Udo Oppermann3 and Bengt Persson1 2 4 1 IFM Bioinformatics Linkoping University Sweden 2 Department of Celland Molecular Biology CMB Karolinska Institutet Stockholm Sweden 3 StructuralGenomics Consortium The Botnar Research Centre NIHR BiomedicalResearch Unit University of Oxford UK 4 NationalSupercomputer Centre NSC and Swedish E-science Research Centre SERC Linkoping University Sweden Keywords bioinformatics classification genomes hidden Markov model short-chain dehydrogenases reductase Correspondence B. Persson IFM Bioinformatics Linkoping University S-581 83 Linkoping Sweden Fax 46 13 137 568 Tel. 46 13 282 983 E-mail bpn@ifm.liu.se Received 23 August 2009 revised 12 February 2010 accepted 16 March 2010 doi 10.1111 j.1742-4658.2010.07656.x The short-chain dehydrogenase7 reductase SDR superfamily now has over 47 000 members most of which are distantly related with typically 2030 residue identity in pairwise comparisons making it difficult to obtain an overview of this superfamily. We have therefore developed a family classification system based upon hidden Markov models HMMs . To this end we have identified 314 SDR families encompassing about 31 900 members. In addition about 9700 SDR forms belong to families with too few members at present to establish valid HMMs. In the human genome we find 47 SDR families corresponding to 82 genes. Thirteen families are present in all three domains Eukaryota Bacteria and Archaea and are hence expected to catalyze fundamental metabolic processes. The majority of these enzymes are of the extended type in agreement with earlier findings. About half of the SDR families are only found among bacteria where the classical SDR type is most prominent. The HMM-based classification is used as a basis for a sustainable and expandable nomenclature system. Introduction The short-chain dehydrogenase reductase SDR
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
Kỷ yếu tóm tắt báo cáo khoa học: Hội nghị khoa học tim mạch toàn quốc lần thứ XI - Hội tim mạch Quốc gia Việt Nam
Báo cáo nghiên cứu khoa học: "Danh lục các loài thú ở khu bảo tồn thiên nhiên Pù Huống tỉnh Nghệ An và ý nghĩa bảo tồn nguồn gen quí hiếm của chúng"
Báo cáo khoa học: Hỗ trợ nâng cao năng lực quản lý chất thải sinh hoạt tại thành phố Hội An
Báo cáo nghiên cứu khoa học: "Tính năng động nghệ thuật của văn học hiện đại Việt Nam và một cách nhìn hành trình thể loại"
Báo cáo nghiên cứu khoa học: " DỊCH CHUYỂN TRUY VẤN OQL VÀO CÁC PHÉP TÍNH BAO HÀM"
Báo cáo khoa học: " Áp dụng thủ tục phân tích trong kiểm toán báo cáo tài chính"
Báo cáo nghiên cứu khoa học: "Người lính trở về sau chiến tranh với mặc cảm “ăn mày dĩ vãng’ trong tiểu thuyết Chu Lai"
Báo cáo nghiên cứu khoa học: "Khảo sát hiện tượng chuyển đổi chức năng - nghĩa của động từ tiếng Việt"
Báo cáo nghiên cứu khoa học: " BẢN CHẤT KHOA HỌC VÀ CÁCH MẠNG LÀ CỘI NGUỒN SỨC SỐNG CỦA CHỦ NGHĨA MÁC - LÊNIN"
Báo cáo khoa học: " CẢI TIẾN CÁC THUẬT TOÁN MƯỢN VÀ KHOÁ KÊNH TẦN SỐ MẠNG DI ĐỘNG TẾ BÀO"
crossorigin="anonymous">
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.